食品经营许可证的申请流程如下：

1.首先，填写食品经营许可证申请表。

2.准备好公司身份证、员工身份证、健康证的复印件。然后制定食品安全管理制度。

3.画出商店的平面图。提交完税证明，证明你用的税是正规自来水公司提供的。

4.向当地市场监督管理局提交以下资料：

(一)《食品流通许可申请书》；

(二)《名称预先核准通知书》复印件；

(三)与食品经营相适应的经营场所使用证明；

(四)负责人和食品安全管理人员的身份证明；

(五)与食品经营相适应的经营设备和工具清单；

(六)与食品经营相适应的经营设施的空间布局和操作流程文件；

(七)食品安全管理制度文本；

(八)省、自治区、直辖市工商行政管理局规定的其他材料。

5.信息提交成功后，市场监督管理局将安排人员到现场参观。

6.检验合格后，通知申请人在一定期限内领取食品经营许可证。